1) Для разбиения на разделы, для проверки разделов мне нравится использовать PartitionMagic.( С помощью PartitionMagic можно также изменить активный раздел )
2) Утилита Нортона DiskEdit. С её помощью можно, например, сохранить содержимое загрузочного сектора, master boot record в файле и если понадобится, восстановить
3) Полезно иметь загрузочный CD, или загрузочную дискету.